Darwin

We select the best microorganisms for our client. We
are supported by our vast know-how in microbial ecology
and our years of experience in industrial applied microbiology


By sequencing the total DNA of a sample, we can identify and quantify all the microbial species that are present: bacteria, fungi, yeasts and other eukaryotes. This method can be applied to study practically any microbiome, such as soil, water, food or human-associated. We offer personalized consultancy services adapted to each particular project. 


 

APLICATIONS

  • Analysis of the human gut microbiome.
  • Quality control and pathogen detection in foodstuff.
  • Monitoring and tracing of epidemiological outbreaks that can affect animal health.
  • Monitoring of microbial-based industrial processes.
  • Quality control in soil and water.

 

METODOLOGY

We work with Illumina and Oxford Nanopore sequencing platforms, and we use several sequencing strategies, including metagenomics and metabarcoding of marker genes (16S, ITS, COI), among others.


Microorganisms are key in the production of fermented foods and beverages, such as kefir, beer, wine or sourdough bread. In this process, the microbial starter culture determines not only the organoleptic qualities of the final product, but also its nutritional profile. We offer a wide range of microbial food starters and we also develop personalized starter cultures that are able to give the product the specific characteristics that the client desires.


 

APLICATIONS

  • Sourdough bread production.
  • Fermented beverages: beer, wine, kombucha.
  • Dairy products: beer, kefir, cottage cheese.
  • Preservation of raw meat products.
  • Aroma production

 

METODOLOGY

This services includes not only the experimental characterization of the best starter culture, but also whole genome sequencing of the selected strains and a biosafety analysis.


Probiotics are live microorganisms that remain active in our gut and provide health benefits, for example, through modulation of our microbiota or by interacting with our immune system. Aside from having a large collection of potentially probiotic strains for both human and animal use, we develop probiotic strains with specific activities adapted to our client’s needs.


 

APLICATIONS

  • Antioxidant effects
  • Improved immune system
  • Vitamin synthesis
  • Pathogen inhibition

 

METODOLOGÍA

Screening systems based on prokaryotic and eukaryotic models, and possibility of human trials. This service includes whole genome sequencing of the selected strains and a biosafety analysis.


We analyse the composition of environmental microbial communities with both culture-dependent and culture-independent (high-throughput sequencing) approaches. We have a vast experience in the bioremediation of contaminated sites and in the optimization of biogas production.


 

APLICATIONS

  • Optimization of organic agriculture.
  • Improvement of soil quality.
  • Improvement of anaerobic digestion processes.
  • Biorremediation of contaminated water.

 

METODOLOGY

Biostimulation and bioaugmentation. Real-time monitoring of microbial communities with portable sequencing strategies.


58
Locations
75
Types of samples
130
Species
642
Strains

 

We have an extensive collection with over 600 microbial strains belonging to more than 100 microbial species, all of them isolated at DARWIN from a wide range of samples (soil, fermented vegetables, breast milk, newborn and breastfed infant feces, etc.). These strains have three main areas of application: food starters, probiotics, and energy and environment.

Our collection is periodically updated with new microbial species. We continuously work to improve the functional and genomic characterization of all of our isolates.


 

OUR MOST REQUESTED SPECIES:

Lactobacillus brevis
Lactobacillus fermentum
Lactobacillus pentosus
Lactobacillus plantarum
Lactobacillus rhamnosus
Lactobacillus sakei
Lactococcus lactis
Leuconostoc mesenteroides
Pediococcus pentosaceus
Saccharomyces cerevisiae

Contact us to find out more about our collection of microbial strains.


A través de la secuenciación del ADN total de una
determinada muestra, podemos identificar y cuantificar todas
las especies microbianas presentes: bacterias, hongos y
otros eucariotas. Este método es aplicable al estudio de
cualquier microbioma, ya sea suelo, agua, alimentos o el
cuerpo humano. Asesoramiento personalizado en función de
cada caso.


APLICACIONES
• Análisis de microbiota intestinal humana.
• Control de calidad y detección de patógenos en matrices
alimentarias.
• Seguimiento de brotes epidemiológicos en salud animal.
• Monitorización de procesos industriales basados en
microorganismos.
• Control de calidad de suelos y aguas.


METODOLOGÍA
Trabajamos con las plataformas Illumina y Oxford Nanopore.
Estrategias de secuenciación: metagenómica, metabarcoding
de genes marcadores (16S, ITS, COI), y otros.


Los microorganismos son clave para elaborar alimentos fermentados como el kéfir, la cerveza, el vino o el pan de masa madre. En este proceso el starter determina no sólo las cualidades organolépticas del alimento, también su perfil nutricional. Disponemos de una variada colección de starters, y además desarrollamos starters personalizados, capaces de conferir al producto las características deseadas por el cliente.


APLICACIONES
• Producción de pan de masa madre.
• Bebidas fermentadas: cerveza, vino, kombucha.
• Lácteos: quesos, kéfir, requesón.
• Conservación de carnes crudas.
• Producción de aromas.


METODOLOGÍA
Este servicio incluye no sólo la caracterización experimental del mejor starter, sino también la secuenciación del genoma de las cepas seleccionadas y el análisis de bioseguridad.


Los probióticos son microorganismos que se mantienen activos en el intestino, desde donde aportan muchos beneficios, por ejemplo modulando la microbiota o interactuando con el sistema inmunológico. Además de contar con una amplia colección de cepas potencialmente probióticas, tanto para humanos como para uso animal, desarrollamos cepas con actividades específicas según la demanda del cliente.


APLICACIONES
• Efecto antioxidante.
• Mejora del sistema inmunitario.
• Síntesis de vitaminas.
• Inhibición de patógenos.


METODOLOGÍA
Sistema de cribado basado en modelos procariotas y eucariotas, y posibilidad de realizar ensayos en humanos. Este servicio incluye la secuenciación del genoma de las cepas seleccionadas y el análisis de bioseguridad.


Mediante técnicas de cultivo y de secuenciación masiva, analizamos la composición de comunidades microbianas ambientales. Tenemos una sólida experiencia en biorremediación de ambientes contaminados, y en la optimización de plantas de biogás.


APLICACIONES
• Optimización de agricultura ecológica.
• Mejora de la calidad del suelo.
• Procesos de digestión anaerobia.
• Biorremediación de aguas contaminadas.
• Mejora de la producción de biogás.


METODOLOGÍA
Bioestimulación y bioaumentación. Seguimiento de comunidades microbianas a tiempo real mediante secuenciación portátil.